Leven als een microbe op het Tibetaanse plateau is niet eenvoudig. Vriestemperaturen, veel zonnestraling, niet veel voedsel, en afhankelijk van de tijd van het jaar zal het regelmatig vriezen en daarna ontdooien.
Daarom is het verrassend dat wetenschappers in deze “extreme omgevingsomstandigheden” 968 soorten hebben ontdekt die worden gekenmerkt door een zeer diverse reeks microben. Deze ontdekking komt met dank aan de eerste catalogus van genomen gewijd aan een glaciaal ecosysteem.
“Gletsjeroppervlakken ondersteunen een verscheidenheid aan leven, waaronder bacteriën, algen, archaea, schimmels en andere micronucleus. Micro-organismen hebben aangetoond dat ze zich kunnen aanpassen aan deze extreme omstandigheden en bijdragen aan vitale ecologische processen.” Het team schrijft op hun nieuwe papier.
“IJzig ijs kan ook dienen als een record van micro-organismen uit het verleden, waardoor met succes oude micro-organismen in de lucht (meer dan 10.000 jaar oud) nieuw leven worden ingeblazen. Daarom vormt het ijzige microbioom ook een onschatbare tijdlijn van het microbiële leven op onze planeet.”
Onderzoekers slijpen specifieke reeks gletsjers – Tibetaans Plateau. Dit gebied van 2,5 miljoen vierkante kilometer is een belangrijke waterbron voor de omliggende regio’s in Azië en is bijzonder getroffen door klimaatverandering, waarbij meer dan 80 procent van de gletsjers zich beginnen terug te trekken.
Het is niet alleen belangrijk voor ons om te weten welke microben er zijn (voor het geval ze een probleem vormen voor de mens en het ecosysteem wanneer het ijs smelt), maar als we de huidige niet opmerken, Klimaatverandering Het kan ervoor zorgen dat ze binnenkort verloren gaan in de geschiedenis.
“Hier presenteren we de eerste genoom- en genencatalogus van gletsjerecosystemen, voor zover ons bekend, bestaande uit 3.241 genomen, metagenoom-geassembleerde genomen en 25 miljoen niet-overtollige eiwitten van 85 Tibetaanse glaciale metagenomica en 883 gecultiveerde isolaten,” het team werd geleid door een ecoloog aan de Universiteit van Tibet. Lanzhou, Yongqin Liu, schrijven in hun krant.
De onderzoekers hebben enorm veel moeite gedaan om monsters te nemen van sneeuw, ijs en bodem van 21 gletsjers in Tibet tussen 2016 en 2020. Ze gebruikten metagenomische methoden op monsters om al het aanwezige genetisch materiaal te verzamelen; Ze kweekten ook enkele van de microben in het laboratorium om meer over hen te weten te komen en een hoger percentage van hun genoom te verkrijgen.
Verrassend genoeg was 82% van de genomen van nieuwe soorten. Elf procent van de megafauna-soorten komt voor in slechts één gletsjer, terwijl 10 procent wordt aangetroffen in bijna alle onderzochte gletsjers.
Het project is uitgegroeid tot wat onderzoekers de “Tibet Glacier Genome and Gene” (TG2G)-catalogus noemen, en we hopen dat dit in de toekomst van nut zal zijn voor onderzoekers, met nieuwe toevoegingen naarmate er meer soorten worden gevonden.
“De TG2G-catalogus biedt een database en platform om het glaciale microbioom op genoom- en genetisch niveau te archiveren, analyseren en vergelijken. Het is vooral relevant omdat het gletsjerecosysteem wordt bedreigd door de opwarming van de aarde en gletsjers zich in een ongekend tempo terugtrekken.” Het team schrijft.
“We stellen ons voor dat de catalogus de basis zal vormen van een uitgebreide wereldwijde opslagplaats van glaciale microbioomgegevens.”
De zoekopdracht is gepubliceerd in natuur biotechnologie.
“Reisliefhebber. Onruststoker. Popcultuurfanaat. Kan niet typen met bokshandschoenen aan.”